- (1560) Traslado de la Corte a Madrid.

 - (1560) Muere en Toledo, a los 51 años, Melchor Cano, teólogo de Carlos V y asesor religioso de Felipe II.

 - (1560) Confirmación de la boda de Felipe II (33 años) con Isabel de Valois (13 años).

 - (1560) El sultán Muley Abdalá el Galib Billah cede el Peñón de Alhucemas al Rey Felipe II para su lucha contra el Imperio Otomano.

- (1560) Derrota de la armada española frente a los turcos en Djerba.

 - (1561) Jura como Príncipe de Asturias don Carlos, hijo de Felipe II. Es el primer acto oficial de don Juan de Austria.

 - (1561) Comienza la retirada de tropas españolas de Flandes.

 - (1560) La Biblia de Ginebra, publicada por los seguidores de John Calvin (‘calvinistas’), es la primera que incluye numeración de los versos y los capítulos.

 - (1561) Auto de fe en Sevilla contra posibles protestantes.

 - (1561) Se traslada la capital de España a Madrid, que anteriormente estaba en Toledo.

 - (1561) Nace en Córdoba Luis de Góngora y Argote, que será famoso poeta.

 - (1561) Muere en Toledo, a los 71 años el escultor Alonso Berruguete. Fue el escultor castellano del manierismo.

 - (1561) Nace Jacobo Pieri compositor de ópera. Se le considera el creador de la ópera.

 - (1560) Comienza a extenderse el cultivo de tabaco en España y Portugal.

 - (1560) Aumento del impuesto sobre la Seda en Granada.

 - (1561) El embajador francés en Lisboa, Jean Nicot, envía hojas y semillas de tabaco a la reina madre Catalina de Médici. El apellido de este embajador será el origen del nombre de la ‘nicotina’.

 - (1560) Muere Francisco II de Francia. Carlos IX (con 10 años) rey de Francia, resulta sucesor de su hermano. La regencia la ejerce su madre Catalina de Médici.

 - (1560) Amberes (actual Bélgica) alcanza su mejor época como puerto comercial, con un movimiento de más de 500 buques mercantes diarios.

 - (1560) Tumultos en Flandes. El rey Felipe II de España envía al Duque de Alba, que actuó con mano muy dura.

  - (1560) Se proclama la bula de creación del Concilio de Trento.

 - (1560) Tolerancia religiosa en Transilvania.

 - (1561) Nace en Londres el que será político y filósofo Francis Bacon .

 - (1561) Lope de Aguirre en su expedición por el río Amazonas, asesina a su hija para que no caiga en manos de sus enemigos.

 - (1563) Felipe II ordena la puesta en marcha de la construcción del futuro monasterio de San Lorenzo en El Escorial (Madrid). Se pone la primera piedra.

 - (1564) Edicto real de Felipe II que obliga el cumplimiento en Flandes de los decretos del concilio de Trento, pieza fundamental de la Contrarreforma contra el Protestantismo.

 - (1564) Por mandato de Felipe II, recuperación del Peñón de Vélez de la Gomera por Fernando Álvarez de Toledo, Marqués de Villafranca y Virrey de Cataluña.

 - (1562) Nace en Madrid Félix Lope de Vega y Carpio.

 - (1562) Teresa de Ávila  arregla el desorden de la Orden Carmelita.

 - (1562) Primer transporte y venta de esclavos negros, dirigido por el pirata y mercader inglés al servicio de la corona española John Hawkins, hacia La Española.

 - (1562) En un Auto de Fe, celebrado en Sevilla por la Inquisición, se quema una imagen de Casiodoro de Reina, religioso español que se hizo protestante. Sus obras fueron incluidas en el 'Índice de libros prohibidos'. además, se le proclama 'jefe de herejes'.

 - (1563) Juan Bautista de Toledo inicia la construcción del monasterio de El Escorial.

 - (1563) Muere a los 68 años, en Granada, el escultor y arquitecto Diego de Siloé.

 - (1564) Muere en Roma, a los 89 años, Miguel Ángel.

 - (1564) Muere en Ginebra, a los 55 años, Juan Calvino (John Calvin), reformador religioso.

 - (1564) Nace William Shakespeare en Strattford (Inglaterra).

 - (1564) Segundo transporte de esclavos negros hacia América.

 - (1564) Diego de Espinosa es nombrado Inquisidor General.

 - (1563) Descubrimiento de minas de mercurio en Huancavelica (Perú).

 - (1564) Felipe II encarga a Juanelo Turriano la construcción de un artilugio que permitiera suministrar agua potable a la ciudad de Toledo desde el río Tajo.

 - (1564) Nace en Pisa (Italia) Galileo Galilei, el que será científico revolucionario.

 - (1564) Juan de Herrera construye el Palacio Real de Aranjuez.

  - (1562) Se inician las ‘Guerras de Religión’ en Francia entre católicos y protestantes, como en otras partes de Europa.

 - (1562) Catalina de Médici promulga en Francia el "edicto de enero" que consagra la libertad de conciencia y la libertad de culto para los protestantes.

 - (1563) Agitación en los Países Bajos contra Felipe II.

 - (1563) Inicio de la Contrarreforma en Baviera, baluarte del catolicismo.

 - (1563) Vigésima y última sesión del Concilio de Trento. Se clausura oficialmente.

 - (1564) Aplicación en los Países Bajos de los decretos del Concilio de Trento. Auge de la Inquisición.

- (1564) Muere en Viena, a los 61 años, el emperador Fernando I de Austria, hermano de Carlos V. Su hijo mayor pasa a ser emperador del Sacro Imperio Germánico como  Maximiliano II. Defenderá la libertad religiosa.

  - (1565) Francisco de Borgia (de Borja), III general de la Compañía de Jesús.

 - (1565) Boda de Alejandro Farnesio (duque de Parma) con María de Portugal (María de Avis y Braganza).

 - (1565) Miguel López de Legazpi funda una colonia en las islas que se llamarán Filipinas en honor al rey de España.

 - (1565) Diego de Espinosa, presidente del Consejo de Castilla.

 - (1565) Malas cosechas en toda Europa. Catalina de Médici (Francia) ordena que las comidas se limiten a tres platos. 

 - (1565) Primer lapicero con ‘mina’ de grafito.

 - (1565) El ‘Colegio Real de Físicos’ de Londres, recibe autorización para efectuar disecciones en cadáveres humanos.

 - (1565) John Hawkins introduce el tabaco de Florida en Inglaterra.

 - (1565) Los Países Bajos  piden libertad religiosa y política.

 - (1565) El militar portugués Estácio de Sá  funda la ciudad de São Sebastião do Rio de Janeiro (San Sebastián del río de enero) en Brasil.

 - (1565) Pedro Menéndez de Avilés funda el primer asentamiento europeo permanente en Norte América, en Florida. Se denominará San Agustín. Es la ciudad más antigua de EE.UU.

 - (1565) La Compañía de Jesús restaura la supremacía católica en Polonia.

 - (1565) Los Turcos sitian Malta, cuartel general de los corsarios españoles. Son rechazados por los Caballeros de San Juan.

 - (1565) Se funda en Londres la Primera Bolsa de comercio, construida por flamencos, siguiendo el modelo de la de Amberes. 

 - (1565) Fallece el papa de Roma Pio IV.